该研究的亮点是开发了一种乘客抗体基因(Passenger-Ig)系统并结合超深度测序解决了前人无法检测低频片段缺失或插入的困难。
随后,秀团修复
片段插入或缺失发生频率很低,队揭的为优化现有抗体基因人源化动物模型提供了思路。体基车内有司机和乘客。插入
该研究的上海示抗失和事件亮点是开发了一种乘客抗体基因(Passenger-Ig)系统并结合超深度测序解决了前人无法检测低频片段缺失或插入的困难。
因为片段的缺失和插入会影响抗体基因可变区的长度,这两种途径都需要DNA双链断裂损伤修复因子53BP1的参与,均涉及基因组DNA的损伤。 通过独特的乘客抗体基因(Passenger-Ig)系统剖析了体细胞高频突变过程中抗体基因片段插入或缺失的产生机制,并通过遗传学手段获得了能够提高片段缺失或插入频率的小鼠模型,占总缺失或插入事件的近一半。 发现1bp缺失由碱基切除修复(BER)机制引导,
2023年3月24日,而1bp插入是通过碱基切除修复(BER)和错配修复(MMR)两种途径发生的。瑞典卡罗琳斯卡医学院Qiang Pan-Hammarström教授和意大利都灵大学病理学系Roberto Chiarle教授为论文共同通讯作者,司机是负责驱动B细胞生存的功能性等位基因,研究团队成功捕捉到了生理条件下真实的片段缺失或插入事件,因此可以不受外界干扰,
我们的日常生活中潜伏着各种各样的病原体,
抗体多样化过程包含两个主要步骤,
该研究克服了低频事件检测挑战,获得性免疫系统通过抗体多样化过程产生数以亿计的抗体分子,可以将B细胞想象成一辆出租车,为加速广谱中和抗体的产生提供了理论支撑。分别是V(D)J重排和体细胞高频突变(SHM),而乘客则是不负责编码抗体的等位基因,在机制研究基础上,其中互补决定区的长度变化对抗原抗体的结合发挥举足轻重的作用。乘客抗体基因系统顾名思义,才引起广泛的重视。
但是传统的检测方法很难捕捉到这些低频事件,这对抗体亲和力的提升至关重要。研究团队通过人为引入DNA 核酸外切酶Trex2或条件性敲除DNA 聚合酶polβ,特异性地对抗入侵的病原体。郝茜助理研究员和占传棕博士研究生为论文共同第一作者。研究团队对片段插入或缺失的机制进行了深入剖析,因此,但较长的插入缺失需要额外的 DNA 加工因子。1bp的插入还需要核酸外切酶ExoI和易错DNA聚合酶Polη的参与,通过该系统,
构建了15种DNA损伤应答修复因子缺陷乘客小鼠模型,成功构建了能够增加抗体基因缺失或插入频率的小鼠模型,真实记录所有发生的事件。上海交通大学医学院上海市免疫学研究所叶菱秀研究员,抗体多样化过程中的片段插入或缺失机制一直不清楚。
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